Vedoucí skupiny: doc. RNDr. Jan Bobek, Ph.D. (jan.bobek@lf1.cuni.cz, tel. +420 224 968 592).

Studujeme buněčnou diferenciaci a produkci sekundárních metabolitů u aktinobakterií ze skupiny streptomycet a příbuzných organismů. Tyto bakterie jsou výjimečné komplexním vývojem a slouží jako klíčový zdroj bioaktivních látek s antimikrobiálními, imunomodulačními, kancerostatickými účinky s vysokým potenciálem pro humánní medicínu. Zaměřujeme se na systémovou analýzu genové exprese při vývojových přechodech, zejména na pleiotropní regulace prostřednictvím sigma faktorů a malých regulačních RNA, s cílem vytvářet mutantní kmeny se zvýšenou produkcí antibiotik. Ve spolupráci s Ústavem půdní biologie Biologického Centra AV ČR izolujeme nové kmeny autonomních či s hostitelem-asociovaných streptomycet. Ve spolupráci s klinickými pracovišti po celé ČR shromažďujeme a charakterizujeme unikátní sbírku streptomycet izolovaných z lidských klinických vzorků, u nichž hodnotíme jejich patogenní a bioaktivní potenciál. Testování nových produkčních kmenů nám umožňuje objevovat nové látky účinné na rezistentní mikroorganismy, látky s protizánětlivým efektem nebo slibné kandidáty pro biotechnologické aplikace a produkci modifikovaných a hybridních metabolitů. Spolupracujeme též na vývoji biodegradačních procesů pro rozklad reziduí makrolidových antibiotik v odpadních vodách a půdě pomocí specializovaných izolátů streptomycet s cílem přispět ke snížení environmentální zátěže a předcházení nárůstu rezistencí patogenních bakterií k makrolidům.

Webové stránky výzkumné skupiny: https://bacterlab.lf1.cuni.cz/

Vedoucí skupiny: prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc. (libuse.kolarova@lf1.cuni.cz, tel. +420 224 968 459).

Základní výzkum naší skupiny je zaměřen na studium interakcí mezi helminty a hostiteli, které mohou na jedné straně sice poškozovat, ale na straně druhé mohou i přispívat k modifikaci jejich imunitní odpovědi v boji proti jiným závažným onemocněním. Účast vybraných druhů helmintů v navozování onemocnění je studována na zvířecích modelech, ale díky spolupráci s lékařskými pracovišti, i u lidských pacientů. Výzkum je zaměřen zejména na studium patogeneze vybraných helmintárních infekcí a na imunitní odpověď u hostitelů s různým stupněm imunitního pozadí, v neposlední řadě pak na nové možnosti terapie nákaz vyvolaných parazity. Naším hlavním zaměřením je sledování vlivu infekce Toxocara spp. na imunitní systém paratenického hostitele, zejména s ohledem na autoimunitní onemocnění. Na laboratorních zvířatech pracujeme s modelem indukované experimentální autoimunitní encefalomyelitidy, který je využíván jako vhodná alternativa pro studium roztroušené sklerózy. Studium motolic čeledi Schistosomatidae je ve spolupráci se zahraničními pracovišti zaměřeno na možnosti hodnocení rizik šíření schistosomózy v endemických oblastech a na hodnocení účinku nově navrhovaných látek s antischistosomálním účinkem. Aplikovaný výzkum se především zabývá etiologií autochtonních a nově se objevujících helmintóz na našem území (např. alveolární echinokokóza a dirofilarióza). Nedílnou součástí této činnosti je studium epidemiologických aspektů uvedených a jiných (toxokaróza) infekcí, zvláště pak rizik infekce parazity, a vývoj nových diagnostických metod vedoucích k průkazu infekčních agens.

Webové stránky výzkumné skupiny: https://helmintlab.lf1.cuni.cz/

Vedoucí skupiny: RNDr. Pavla Tůmová, Ph.D. (pavla.tumova@lf1.cuni.cz, tel. +420 224 968 465).

Naše laboratoř má dlouhodobou tradici. Dříve byla součástí infekční kliniky Fakultní nemocnice Na Bulovce a působila jako NRL pro diagnostiku tropických parazitárních infekcí (pod vedením Dr. Evy Nohýnkové). Věnujeme se výzkumu původců řady protozoárních nákaz a u některých z nich fungujeme i jako konzultační pracoviště pro zdravotnická pracoviště. V posledních letech je naším hlavním modelovým organismem Giardia intestinalis. Tento lidský střevní parazit je nejčastějším původcem průjmových onemocnění parazitárního původu. Ročně způsobuje až 200 milionů akutních i chronických případů giardiózy. Jeho výzkum je již od jeho prvního popisu v roce 1859 lékařem Dušanem Lamblem spojen i s naší fakultou. Naše výzkumná skupina připívá k poznání strukturního a funkčního uspořádání cytoskeletu, buněčného cyklu a organizace genomu tohoto dvojjaderného parazita. Věnujeme se molekulární epidemiologii giardií a identifikaci mechanismů a markerů rezistence k léčivům, především metronidazolu. Využíváme a rozvíjíme multiomické přístupy i pokročilé mikroskopické a molekulární techniky. Vážíme si četných mezinárodních i národních spoluprací, podílíme se na vedení magisterských a PhD. studentů.

Webové stránky výzkumné skupiny: https://giardialab.lf1.cuni.cz/

Vedoucí skupiny: doc. Ing. Karel Holada, Ph.D. (karel.holada@lf1.cuni.cz, tel: +420 224 968 503).

Prionová laboratoř je zaměřena především na základní výzkum prionů, diagnostiky prionových chorob a dalších proteinopatií a studium buněčné toxicity nanočástic.

Webové stránky výzkumné skupiny: http://www.prionlab.cz

Vedoucí skupiny: MUDr. Zora Mělková, Ph.D. (zora.melkova@lf1.cuni.cz, tel. +420 224 968 507).

Výzkum Virologické laboratoře je zaměřen na studium interakcí virů s hostitelem. Máme rozsáhlou zkušenost s poxviry, především s virem vakcínie, vakcinačním vektorem proti černým neštovicím. V poslední době se věnujeme výzkumu redoxního stresu, indukovaného především hem arginátem (Normosang) a disulfiramem (Antabus), při reaktivaci a eliminaci HIV-1. Také studujeme protivirové a imunomodulační vlastnosti hem arginátu a dalších látek účinných proti SARS-CoV-2. Výchova postgraduálních a magisterských studentů a podpora jejich práce na dizertačních a diplomových pracích tvoří nedílnou součást laboratorní problematiky.

Webové stránky výzkumné skupiny: https://nolab.lf1.cuni.cz/